Xã hội Nhật Bản bước sang một thời kì mới, thời kì xã hội ứng dụng trí thông minh nhân tạo (AI) trong mọi mặt đời sống. Đặc biệt là thế hệ robo AI tên gọi HumaGear (ヒューマギア, / Hyūmagia?), do tập đoàn công nghệ Hiden Inteligence (飛電インテリジェンス, Hiden Interijensu?) phát triển.

Tuy nhiên, có một tổ chức khủng bố không muốn HumaGear phục vụ xã hội loài người tốt hơn nên đã hack vào hệ thống HumaGear hòng lợi dụng tiêu diệt nhân loại. Tổ chức đó gọi là MetsubouJinrai.net (滅亡迅雷.net (Diệt vong Tấn lôi), MetsubōJinrai netto?).

Chính phủ Nhật Bản đánh hơi được tổ chức này nên đã thành lập cơ quan đặc biệt chống AI gọi tắt là A.I.M.S (エイムズ, Eimuzu?, Artificial Intelligence Milarity Service), trực tiếp báo cáo cho chính phủ. A.I.M.S có nhiệm vụ săn lùng các HumaGear đã bị hack và duy trì an ninh sự vụ liên quan AI.

Nhân vật chính là Hiden Aruto, một chàng trai có mơ ước trở thành diễn viên hài kịch, mặc dù nghề này đã bị thay thế bởi HumaGear. Khi ông nội của Aruto là Hiden Korenosuke, nhà sáng lập kiêm chủ tịch Hiden Inteligence qua đời, Aruto được ông nội chỉ định làm tân chủ tịch của Hiden Inteligence theo như di chúc.

Aruto không hứng thú với chức chủ tịch tập đoàn lớn, nhưng tận mắt chứng kiến tình cảnh thảm thương của HumaGear do MetsubouJinrai.net hack nên cậu quyết định nhậm chức và sử dụng Zero-One Driver (chỉ có chủ tịch Hiden Inteligence mới kích hoạt được) và biến thân thành Kamen Rider Zero-One.

Aruto chính thức bước vào trận chiến vì các HumaGear. Không chỉ chống lại MetsubouJinrai.NET và còn cả A.I.M.S, nơi không mấy thân thiện với AI và HumaGear.[3]